重庆朝天门历来是重庆的水陆交通要道，此处旅客聚集，物资集散，人来人往很多，江面船舶汽笛长鸣，穿梭往来，好不热闹。在朝天门启动改造之前，码头区域交通甚为方便，公交车线路众多，通往主城区各个重点区域。然而，因为码头改造和来福士广场的修建，码头交通一度受阻，狭窄的道路和寥寥无几的公交不能满足大量的重庆两江游游客和三峡旅游游客交通之需要，以致游客们对此时有怨言。
日期，经过有关部门的调研和争取，码头的交通大幅改善，新开行了好几条公交线路。截止日前，到重庆港九码头的公交线路达到了5条，分别是414线路、440线路、480线路（环线）、480线路（起点站）和503线路。414线路运行于重庆港九码头到菜园坝火车站之间，440线路运行于重庆港九码头到小米市之间，480线路（环线）运行于解放碑-码头-解放碑，呈环线运行，480线路（起点站）运行于重庆港九码头到牛角沱之间，503线路运行于码头到北碚同兴之间，属于长线。至此，重庆主城主要地方如经济中心的解放碑，交通枢纽的菜园坝和牛角沱都有公交线路直达朝天门码头，大大的方便了乘客的出行需要。
此外需要提醒的是，由于码头施工，有关方面对码头交通进行了管制，所有车辆禁止驶入九码头以下区域，仅供人流进出。故您若需要到四码头、五码头乃至八码头登船，则需要从九码头下车步行到登船码头，到最远的码头步行时间不超过十分钟，所以基本不影响出行。
在黄金节假日和人流高峰期，码头区域显得异常拥挤，私家车在此停靠可能会面临着难以找到车位的情况。故驾驶私家车的朋友可以选择离码头较远的地方停车然后步行到码头，或者直接换乘公共交通工具前往。
